Γιατί το NGS είναι καλύτερο από το Sanger;
Γιατί το NGS είναι καλύτερο από το Sanger;

Βίντεο: Γιατί το NGS είναι καλύτερο από το Sanger;

Βίντεο: Γιατί το NGS είναι καλύτερο από το Sanger;
Βίντεο: Next-Generation Sequencing & Sanger Sequencing 2024, Νοέμβριος
Anonim

Το μέγεθος του δείγματος

NGS είναι σημαντικά φθηνότερο, πιο γρήγορο, χρειάζεται σημαντικά λιγότερο DNA και είναι περισσότερο ακριβείς και αξιόπιστες παρά ο Σάνγκερ αλληλουχία. Ας το δούμε αυτό περισσότερο απο κοντα. Για Sanger Αλληλουχία, απαιτείται μεγάλη ποσότητα templateDNA για κάθε ανάγνωση

Οι άνθρωποι ρωτούν επίσης, ποια είναι τα πλεονεκτήματα της αλληλουχίας επόμενης γενιάς;

Το καθένα έχει συγκεκριμένα πλεονεκτήματα για κριτήρια: μήκος ανάγνωσης, ακρίβεια, χρόνος εκτέλεσης και απόδοση. Εκτός από την ανάλυση των αλληλουχιών DNA, η εξέλιξη του αλληλουχία Οι τεχνολογίες οδήγησαν στην ανάλυση άλλων βιολογικών συστατικών όπως το RNA και η πρωτεΐνη, καθώς και στον τρόπο αλληλεπίδρασης τους σε πολύπλοκα κυτταρικά δίκτυα.

Κάποιος μπορεί επίσης να ρωτήσει, γιατί εξακολουθεί να χρησιμοποιείται η αλληλουχία Sanger; Ακολουθία Sanger βελτιώθηκε με την πάροδο των ετών, σε μεγάλο μέρος λόγω του αυτοματισμού, και αποτέλεσε τη βάση για αλληλουχία το πρώτο ανθρώπινο γονιδίωμα το 2000. Σε λιγότερο από δύο δεκαετίες, ωστόσο, το NGS έχει ξεπεράσει Ακολουθία Sanger λόγω της υψηλής απόδοσης, της παράλληλης λειτουργίας και του πολύ χαμηλότερου κόστους.

Συνεπώς, ποια είναι η διαφορά μεταξύ της αλληλουχίας Sanger και της αλληλουχίας επόμενης γενιάς;

Κάθε ενσωματωμένο νουκλεοτίδιο αναγνωρίζεται από τη φθορίζουσα ετικέτα του. Η κριτική διαφορά μεταξύ Sangersequencing και NGS είναι αλληλουχία Ενταση ΗΧΟΥ. Ενώ το Sanger μόνο μέθοδος ακολουθίες ένα μεμονωμένο θραύσμα DNA κάθε φορά, το NGS είναι μαζικά παράλληλο, αλληλουχία εκατομμύρια θραύσματα ταυτόχρονα ανά τρέξιμο.

Πόσο ακριβής είναι η αλληλουχία Sanger;

Ακολουθία Sanger με 99,99% ακρίβεια είναι το «χρυσό πρότυπο» για την κλινική έρευνα αλληλουχία . Ωστόσο, οι νεότερες τεχνολογίες NGS γίνονται επίσης κοινές στα εργαστήρια κλινικής έρευνας λόγω των δυνατοτήτων τους υψηλότερης απόδοσης και χαμηλότερου κόστους ανά δείγμα.

Συνιστάται: