Γιατί χρησιμοποιούμε την αλληλουχία Sanger;
Γιατί χρησιμοποιούμε την αλληλουχία Sanger;

Βίντεο: Γιατί χρησιμοποιούμε την αλληλουχία Sanger;

Βίντεο: Γιατί χρησιμοποιούμε την αλληλουχία Sanger;
Βίντεο: Sanger sequencing 2024, Νοέμβριος
Anonim

Ακολουθία Sanger είναι μια αποτελεσματική προσέγγιση για μελέτες διαλογής παραλλαγών όταν ο συνολικός αριθμός δειγμάτων είναι χαμηλός. Για μελέτες διαλογής παραλλαγών όπου ο αριθμός δείγματος είναι υψηλός, το αμπλικόνιο αλληλουχία με το NGS είναι πιο αποδοτικό και οικονομικό.

Ομοίως, μπορείτε να ρωτήσετε, ποιος είναι ο σκοπός της αλληλουχίας Sanger;

Ακολουθία Sanger είναι η διαδικασία επιλεκτικής ενσωμάτωσης διδεοξυνουκλεοτιδίων που τερματίζουν την αλυσίδα από την πολυμεράση DNA κατά την in vitro αντιγραφή του DNA. είναι η πιο ευρέως χρησιμοποιούμενη μέθοδος για την ανίχνευση SNVs.

Γνωρίζετε επίσης γιατί χρησιμοποιούνται τα ddNTP στην αλληλουχία Sanger; Διδεοξυνουκλεοτίδια είναι αναστολείς επιμήκυνσης της αλυσίδας των DNA πολυμεράση, μεταχειρισμένος στο Sanger μέθοδος για Αλληλουχία DNA . Έτσι, αυτά τα μόρια αποτελούν τη βάση της μεθόδου τερματισμού της διδεοξυ αλυσίδας του Αλληλουχία DNA , το οποίο ανέφερε η Φρειδερίκη Sanger και η ομάδα του το 1977 ως προέκταση παλαιότερης δουλειάς.

Ρωτήθηκε επίσης, γιατί το NGS είναι καλύτερο από το Sanger;

Sanger Η αλληλουχία μπορεί να ακολουθήσει μόνο ένα θραύσμα τη φορά. Επειδή NGS χρησιμοποιεί κύτταρα ροής που μπορούν να δεσμεύσουν εκατομμύρια κομμάτια DNA, NGS μπορεί να διαβάσει όλες αυτές τις ακολουθίες ταυτόχρονα. Αυτό το χαρακτηριστικό υψηλής απόδοσης το καθιστά πολύ οικονομικό κατά την αλληλούχιση μεγάλης ποσότητας DNA.

Τι χρειάζεστε για την ακολουθία Sanger;

Συστατικά για Ακολουθία Sanger Περιλαμβάνουν: Α DNA ένζυμο πολυμεράσης. Ένα αστάρι, το οποίο είναι ένα κοντό κομμάτι μονόκλωνου DNA που συνδέεται με το πρότυπο DNA και δρα ως «μίζα» για την πολυμεράση. Οι τέσσερις DNA νουκλεοτίδια (dATP, dTTP, dCTP, dGTP)

Συνιστάται: